Predictive intelligence for drug discovery

Nullary: цитируемая база отрицательных результатов исследований в разработке лекарств

От сообществаРаботаетБез входаГлобальныйБесплатноТолько чтение

Что умеет

  • Искать неактивные соединения и провалы селективности
  • Искать провалившиеся клинические испытания антител и вакцин
  • Искать неудачные CRISPR-скрины и проблемы essentiality
  • Искать провалы стабильности пептидов и доставки олигонуклеотидов
  • Искать провалы линкеров ADC и форматов биспецификов

Какие данные видит

Доступ к базе публичных научных данных с полной библиографической ссылкой, без авторизации.

Нужен ли аккаунт

Не нужен: сервер работает без входа

Nullary — MCP-сервер со структурированным доступом к отрицательным результатам в разработке лекарств: неактивным соединениям, провалившимся клиническим испытаниям, неудачным CRISPR-скринам и другим модальностям — малым молекулам, антителам, PROTAC, пептидам, олигонуклеотидам. Каждая запись содержит DOI, PMID и ссылку на источник, данные собраны из ChEMBL, PubChem, ClinicalTrials.gov и других баз.

Как подключить

Как подключить Predictive intelligence for drug discovery к Claude

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Claude:

https://drug-discovery.run.tools

  1. Откройте Claude (сайт claude.ai или приложение для компьютера).
  2. Перейдите в Настройки → Коннекторы (в английском интерфейсе: Settings → Connectors).
  3. Нажмите Добавить пользовательский коннектор (Add custom connector).
  4. Вставьте адрес сервера, скопированный ниже, в поле URL удалённого MCP-сервера и нажмите Добавить.
  5. В чате нажмите + → Коннекторы и включите новый коннектор.

Пользовательские коннекторы доступны на тарифах Free, Pro, Max, Team и Enterprise. На Free можно добавить только один. В Team и Enterprise коннектор сначала добавляет владелец организации в Настройки организации → Коннекторы.

Авторизация

После нажатия Добавить откроется окно входа в сервис. Войдите под своим аккаунтом и подтвердите доступ. Пароль Claude не видит.

Как подключить Predictive intelligence for drug discovery к ChatGPT

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках ChatGPT:

https://drug-discovery.run.tools

  1. Откройте ChatGPT в браузере (chatgpt.com). Нужен тариф Plus, Pro, Business, Enterprise или Edu.
  2. Один раз включите режим разработчика: Настройки → Приложения → Дополнительные настройки → Режим разработчика (Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode).
  3. Откройте Настройки → Коннекторы и нажмите Создать (Create).
  4. Заполните форму: Название (любое), Описание (одна фраза, что делает сервис), URL MCP-сервера (скопируйте ниже).
  5. В поле Аутентификация выберите OAuth, если сервис требует вход, иначе Нет. Нажмите Создать.
  6. В новом чате откройте + → Приложения/Коннекторы и включите коннектор.

Название раздела у OpenAI менялось (Connectors → Apps/Plugins). Если пункт называется иначе, ищите «режим разработчика» в настройках. В рабочих пространствах Business/Enterprise администратор должен разрешить пользовательские коннекторы.

Авторизация

При первом использовании ChatGPT откроет окно входа в сервис. Войдите и подтвердите доступ.

Как подключить Predictive intelligence for drug discovery к Cursor

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Cursor:

https://drug-discovery.run.tools

Быстрый способ: нажмите кнопку Открыть в Cursor ниже, Cursor сам предложит добавить сервер.

Вручную:

  1. В Cursor откройте Settings → Cursor Settings → MCP и нажмите Add new global MCP server.
  2. Вставьте JSON, скопированный ниже, в открывшийся файл ~/.cursor/mcp.json (для одного проекта: .cursor/mcp.json в корне проекта).
  3. Сохраните файл. Сервер появится в списке MCP; при необходимости пройдите авторизацию по кнопке рядом с ним.

Авторизация

Если сервис требует вход, рядом с сервером в списке MCP появится кнопка авторизации.

Список инструментов сервера (35)

Технические названия из tools/list. Нужны только разработчикам.

search_inactive_compoundsInactive small-molecule compound-target pairs.
search_failed_selectivitySmall molecules that failed selectivity.
search_admet_failuresSmall-molecule ADMET failures.
search_failed_guidesFailed/ineffective CRISPR guides.
search_failed_essentiality_screensNon-dependency / failed essentiality screens.
search_ancestry_specific_failuresAncestry-specific CRISPR failures.
search_developability_failuresAntibody developability failures.
search_failed_clinical_antibodiesDiscontinued/terminated clinical antibodies.
search_failed_peptide_therapeuticsFailed peptide therapeutics.
search_peptide_stability_issuesPeptide stability/half-life failures.
search_failed_protacsPROTACs that failed degradation/ternary/permeability.
search_protac_e3_issuesPROTAC E3-ligase recruitment / ternary failures.
search_failed_oligonucleotidesASOs/siRNAs that failed engagement/developability.
search_oligo_delivery_failuresOligonucleotide delivery failures.
search_failed_vaccinesFailed/terminated vaccines (by pathogen/indication).
search_vaccine_immunogenicity_failuresFailed vaccine immunogen designs.
search_failed_adcsADCs that failed at any stage.
search_adc_linker_failuresADC failures attributed to linker chemistry.
search_failed_bispecificsBispecifics that failed at any stage.
search_bispecific_format_failuresBispecific format/engineering failures.
search_admet_failures_all_modalitiesADMET failures across ALL modalities.
search_drug_drug_interaction_failuresDrug-drug interaction failures.
search_mechanism_failuresApproaches that failed for a mechanism (by target).
search_failed_replicationsFindings that failed to replicate.
search_safety_failuresClinical/preclinical safety failures across modalities.
search_target_historyALL failed approaches against a target across every modality.
search_indication_historyALL failed approaches for an indication across every modality.
search_pathogen_historyVaccine + antimicrobial + antibody failures for a pathogen.
get_compoundA compound (structure, name, max clinical phase) + its full negative profile across modalities/sources.
get_finding_provenanceFull provenance + detail for a single finding by id.
get_target_landscapeTarget 'graveyard' / exhaustion index: how many distinct compounds/agents have been tried against a target and failed, broken down by modality and outcome. Answers 'how picked-over is this target?'. Accepts a gene symbol (e.g. EGFR) or a UniProt accession (e.g. P00533).
list_top_targetsCoverage browse: the most heavily-pursued ('graveyard') targets, ranked by recorded negative findings. Optional family filter (kinase, gpcr, protease, nuclear_receptor, ion_channel, transporter, phosphatase, other).
list_modelsSummary of the Layer-1 inactivity-scoring model registry: how many per-target models, split by family, and median scaffold-split ROC-AUC.
get_model_cardPer-target Layer-1 model card: training counts and held-out scaffold-split metrics (ROC-AUC, PR-AUC, Brier, calibration). Accepts a gene symbol (e.g. EGFR) or UniProt accession (e.g. P00533).
get_coveragePer-modality and per-source coverage stats (honest Phase-1 numbers).