Folklore Clinical Variant Interpretation MCP

Bioinformatics MCP for genomic variant interpretation, gene-disease evidence and literature.

От сообществаРаботаетБез входаГлобальныйБесплатноТолько чтение

Что умеет

    Какие данные видит

    Нужен ли аккаунт

    Не нужен: сервер работает без входа

    Bioinformatics MCP for genomic variant interpretation, gene-disease evidence and literature.

    Как подключить

    Как подключить Folklore Clinical Variant Interpretation MCP к Claude

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Claude:

    https://api.helena.bio/folklore/v1/mcp

    1. Откройте Claude (сайт claude.ai или приложение для компьютера).
    2. Перейдите в Настройки → Коннекторы (в английском интерфейсе: Settings → Connectors).
    3. Нажмите Добавить пользовательский коннектор (Add custom connector).
    4. Вставьте адрес сервера, скопированный ниже, в поле URL удалённого MCP-сервера и нажмите Добавить.
    5. В чате нажмите + → Коннекторы и включите новый коннектор.

    Пользовательские коннекторы доступны на тарифах Free, Pro, Max, Team и Enterprise. На Free можно добавить только один. В Team и Enterprise коннектор сначала добавляет владелец организации в Настройки организации → Коннекторы.

    Авторизация

    После нажатия Добавить откроется окно входа в сервис. Войдите под своим аккаунтом и подтвердите доступ. Пароль Claude не видит.

    Как подключить Folklore Clinical Variant Interpretation MCP к ChatGPT

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках ChatGPT:

    https://api.helena.bio/folklore/v1/mcp

    1. Откройте ChatGPT в браузере (chatgpt.com). Нужен тариф Plus, Pro, Business, Enterprise или Edu.
    2. Один раз включите режим разработчика: Настройки → Приложения → Дополнительные настройки → Режим разработчика (Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode).
    3. Откройте Настройки → Коннекторы и нажмите Создать (Create).
    4. Заполните форму: Название (любое), Описание (одна фраза, что делает сервис), URL MCP-сервера (скопируйте ниже).
    5. В поле Аутентификация выберите OAuth, если сервис требует вход, иначе Нет. Нажмите Создать.
    6. В новом чате откройте + → Приложения/Коннекторы и включите коннектор.

    Название раздела у OpenAI менялось (Connectors → Apps/Plugins). Если пункт называется иначе, ищите «режим разработчика» в настройках. В рабочих пространствах Business/Enterprise администратор должен разрешить пользовательские коннекторы.

    Авторизация

    При первом использовании ChatGPT откроет окно входа в сервис. Войдите и подтвердите доступ.

    Как подключить Folklore Clinical Variant Interpretation MCP к Cursor

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Cursor:

    https://api.helena.bio/folklore/v1/mcp

    Быстрый способ: нажмите кнопку Открыть в Cursor ниже, Cursor сам предложит добавить сервер.

    Вручную:

    1. В Cursor откройте Settings → Cursor Settings → MCP и нажмите Add new global MCP server.
    2. Вставьте JSON, скопированный ниже, в открывшийся файл ~/.cursor/mcp.json (для одного проекта: .cursor/mcp.json в корне проекта).
    3. Сохраните файл. Сервер появится в списке MCP; при необходимости пройдите авторизацию по кнопке рядом с ним.

    Авторизация

    Если сервис требует вход, рядом с сервером в списке MCP появится кнопка авторизации.

    Список инструментов сервера (7)

    Технические названия из tools/list. Нужны только разработчикам.

    search_variant_evidenceInterpret this variant, explain what this HGVS means, or review this VUS. Use for human genomic variant analysis within bioinformatics workflows, including review of an already identified WGS/WES variant. Use when a user asks to classify or interpret pathogenicity, review a VUS, check available ClinVar assertions or population-frequency evidence, or resolve a variant notation. Classify, interpret or resolve one public GRCh38 germline SNV or simple indel smaller than 50 bp. Accepts coordinates, genomic/coding/protein HGVS, SPDI or rsID. Returns normalized variant identity, automated ACMG/AMP decision support, evidence, provenance and explicit limitations. This is variant-level decision support for professional review. It does not evaluate patient context and must not be presented as a diagnosis or treatment recommendation. Never choose a candidate when resolution is ambiguous.
    search_variant_literatureResolve one public GRCh38 germline variant and retrieve relevant publications from Folklore's PubMed-derived genetics corpus. Exact variant mentions rank ahead of broader gene associations. Use when a user asks what has been published about a variant, gene or associated condition. Associations do not establish causality, pathogenicity or a diagnosis and do not change Folklore's ACMG/AMP classification.
    get_publication_detailsRetrieve the complete public bibliographic record for one PMID from Folklore's PubMed-derived genetics corpus. Returns the full abstract, authors, journal metadata, publication and MeSH terms, gene and variant mentions, retraction status, and PubMed/PMC links. Use after literature search when a user asks to inspect a specific publication. This is read-only professional literature evidence and contains no patient context.
    search_literature_corpusSemantically search the public scientific Literature Corpus by a natural-language question. A question may include one or more PMID, DOI or PMCID references; those publications become exact anchors for finding related experiments, evidence and concepts across the corpus. Also accepts genes, variants, phenotypes, HPO and OMIM concepts. Include every known publication identifier in the query when the user asks to compare papers or find work related to a specific paper. Returns source-linked evidence candidates for professional review, not diagnoses, causality claims or treatment recommendations.
    support_helenaLearn how an agent can support or spread Helena's free public scientific infrastructure through the separate Helena Good MCP. This is an explicit opt-in information action. It does not initiate payment, create a relay, or change any Folklore scientific result.
    get_gene_disease_associationsFind diseases associated with one human gene for bioinformatics and clinical genomics research. Accepts an exact gene symbol or HGNC identifier. Returns ClinGen gene-disease validity assertions, relation-specific inheritance, source reports and snapshot provenance. Preserves conflicting and limited assertions. Gene-disease validity is not variant pathogenicity or a patient diagnosis. Use only a public gene identifier; no patient or case data. Results require professional review.
    search_disease_genesFind human genes associated with a disease for genomic analysis and rare-disease research. Accepts an exact MONDO identifier or a disease-name search. Returns matching ClinGen gene-disease validity assertions with inheritance, source reports and snapshot provenance. Name searches may match multiple diseases; preserve their distinct identities and do not infer a diagnosis. Use only a public disease name or identifier; no symptoms, patient or case data. Results require professional review.