biorxiv-mcp-server

Search and retrieve bioRxiv and medRxiv preprints — by DOI, date interval, or keyword — via MCP.

От сообществаРаботаетБез входаГлобальныйБесплатноТолько чтение

Что умеет

  • Biorxiv List Categories: List valid subject category strings for bioRxiv and medRxiv. Use these strings as the `category` filter in biorxiv_list_recent to narrow results to a specific field. The taxon
  • Biorxiv List Recent: List preprints posted or revised within a date interval, optionally scoped to one server or a subject category. Returns 30 preprints per page (fixed by the API); pass `cursor` as
  • Biorxiv Get Preprint: Fetch full metadata, abstract, all revision history, full-text/PDF links, and published-journal DOI for one or more preprints by DOI. Each DOI returns all revisions in one respon

Какие данные видит

Нужен ли аккаунт

Не нужен: сервер работает без входа

Search and retrieve bioRxiv and medRxiv preprints — by DOI, date interval, or keyword — via MCP.

Как подключить

Как подключить biorxiv-mcp-server к Claude

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Claude:

https://biorxiv-mcp-server--cyanheads.run.tools

  1. Откройте Claude (сайт claude.ai или приложение для компьютера).
  2. Перейдите в Настройки → Коннекторы (в английском интерфейсе: Settings → Connectors).
  3. Нажмите Добавить пользовательский коннектор (Add custom connector).
  4. Вставьте адрес сервера, скопированный ниже, в поле URL удалённого MCP-сервера и нажмите Добавить.
  5. В чате нажмите + → Коннекторы и включите новый коннектор.

Пользовательские коннекторы доступны на тарифах Free, Pro, Max, Team и Enterprise. На Free можно добавить только один. В Team и Enterprise коннектор сначала добавляет владелец организации в Настройки организации → Коннекторы.

Авторизация

После нажатия Добавить откроется окно входа в сервис. Войдите под своим аккаунтом и подтвердите доступ. Пароль Claude не видит.

Как подключить biorxiv-mcp-server к ChatGPT

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках ChatGPT:

https://biorxiv-mcp-server--cyanheads.run.tools

  1. Откройте ChatGPT в браузере (chatgpt.com). Нужен тариф Plus, Pro, Business, Enterprise или Edu.
  2. Один раз включите режим разработчика: Настройки → Приложения → Дополнительные настройки → Режим разработчика (Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode).
  3. Откройте Настройки → Коннекторы и нажмите Создать (Create).
  4. Заполните форму: Название (любое), Описание (одна фраза, что делает сервис), URL MCP-сервера (скопируйте ниже).
  5. В поле Аутентификация выберите OAuth, если сервис требует вход, иначе Нет. Нажмите Создать.
  6. В новом чате откройте + → Приложения/Коннекторы и включите коннектор.

Название раздела у OpenAI менялось (Connectors → Apps/Plugins). Если пункт называется иначе, ищите «режим разработчика» в настройках. В рабочих пространствах Business/Enterprise администратор должен разрешить пользовательские коннекторы.

Авторизация

При первом использовании ChatGPT откроет окно входа в сервис. Войдите и подтвердите доступ.

Как подключить biorxiv-mcp-server к Cursor

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Cursor:

https://biorxiv-mcp-server--cyanheads.run.tools

Быстрый способ: нажмите кнопку Открыть в Cursor ниже, Cursor сам предложит добавить сервер.

Вручную:

  1. В Cursor откройте Settings → Cursor Settings → MCP и нажмите Add new global MCP server.
  2. Вставьте JSON, скопированный ниже, в открывшийся файл ~/.cursor/mcp.json (для одного проекта: .cursor/mcp.json в корне проекта).
  3. Сохраните файл. Сервер появится в списке MCP; при необходимости пройдите авторизацию по кнопке рядом с ним.

Авторизация

Если сервис требует вход, рядом с сервером в списке MCP появится кнопка авторизации.

Список инструментов сервера (5)

Технические названия из tools/list. Нужны только разработчикам.

biorxiv_list_categoriesList valid subject category strings for bioRxiv and medRxiv. Use these strings as the `category` filter in biorxiv_list_recent to narrow results to a specific field. The taxonomy is static and maintained in-server; run this tool before filtering to get the current valid values.
biorxiv_list_recentList preprints posted or revised within a date interval, optionally scoped to one server or a subject category. Returns 30 preprints per page (fixed by the API); pass `cursor` as an integer offset (0, 30, 60, …) to step through additional pages. When server="both" (default), per-server pagination state is returned separately — use each server's `cursor` field for independent advancement. Category filtering is applied server-side; call biorxiv_list_categories for valid category strings.
biorxiv_get_preprintFetch full metadata, abstract, all revision history, full-text/PDF links, and published-journal DOI for one or more preprints by DOI. Each DOI returns all revisions in one response. When server="both" (default), each DOI is checked against both bioRxiv and medRxiv; the response includes which server the preprint was found on. Per-DOI failures are surfaced in failed[] rather than aborting the batch. DOIs must match the pattern 10.NNNN/…
biorxiv_get_published_versionResolve a preprint DOI to its full journal publication record — journal DOI, journal name, published date, and corresponding author details. Use when the preprint's `publishedJournalDoi` field from biorxiv_get_preprint is present and you need the full crosswalk metadata. Returns a not-found error when the preprint is not yet published. Check biorxiv_get_preprint first to confirm the publishedJournalDoi field is populated.
biorxiv_search_preprintsSearch preprints by keyword using EuropePMC for relevance ranking, then enrich matching DOIs with full bioRxiv/medRxiv metadata. Covers both servers by default. EuropePMC indexes new preprints within 1–2 days of posting; for preprints posted within the last day, prefer biorxiv_list_recent. The search backend is EuropePMC — bioRxiv's native search endpoint is not used.