biomcp1

BioMCP — 50+ Biomedical Databases, One Command.

От сообществаРаботаетБез входаГлобальныйБесплатноТолько чтение

Что умеет

  • Biomcp: BioMCP is a read-only biomedical MCP tool for search, detail retrieval, discovery, enrichment, and study analytics across leading public biomedical data sources. # BioMCP Command Reference Bio

Какие данные видит

Нужен ли аккаунт

Не нужен: сервер работает без входа

BioMCP — 50+ Biomedical Databases, One Command. Production-grade read-only biomedical MCP server unifying PubMed, ClinicalTrials.gov, ClinVar, gnomAD, OncoKB, Reactome, KEGG, UniProt, PharmGKB, CPIC, OpenFDA, Monarch Initiative, GWAS Catalog, cBioPortal, FAERS, and more. Supports gene/variant/disease/drug/article/trial/phenotype/pathway/p rotein/GWAS/PGx/adverse-event search, detail retrieval, and enrichment. Use biomcp suggest "" to get started. Apache-2.0 licensed.

Как подключить

Как подключить biomcp1 к Claude

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Claude:

https://biomcp1--gucci10248.run.tools

  1. Откройте Claude (сайт claude.ai или приложение для компьютера).
  2. Перейдите в Настройки → Коннекторы (в английском интерфейсе: Settings → Connectors).
  3. Нажмите Добавить пользовательский коннектор (Add custom connector).
  4. Вставьте адрес сервера, скопированный ниже, в поле URL удалённого MCP-сервера и нажмите Добавить.
  5. В чате нажмите + → Коннекторы и включите новый коннектор.

Пользовательские коннекторы доступны на тарифах Free, Pro, Max, Team и Enterprise. На Free можно добавить только один. В Team и Enterprise коннектор сначала добавляет владелец организации в Настройки организации → Коннекторы.

Авторизация

После нажатия Добавить откроется окно входа в сервис. Войдите под своим аккаунтом и подтвердите доступ. Пароль Claude не видит.

Как подключить biomcp1 к ChatGPT

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках ChatGPT:

https://biomcp1--gucci10248.run.tools

  1. Откройте ChatGPT в браузере (chatgpt.com). Нужен тариф Plus, Pro, Business, Enterprise или Edu.
  2. Один раз включите режим разработчика: Настройки → Приложения → Дополнительные настройки → Режим разработчика (Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode).
  3. Откройте Настройки → Коннекторы и нажмите Создать (Create).
  4. Заполните форму: Название (любое), Описание (одна фраза, что делает сервис), URL MCP-сервера (скопируйте ниже).
  5. В поле Аутентификация выберите OAuth, если сервис требует вход, иначе Нет. Нажмите Создать.
  6. В новом чате откройте + → Приложения/Коннекторы и включите коннектор.

Название раздела у OpenAI менялось (Connectors → Apps/Plugins). Если пункт называется иначе, ищите «режим разработчика» в настройках. В рабочих пространствах Business/Enterprise администратор должен разрешить пользовательские коннекторы.

Авторизация

При первом использовании ChatGPT откроет окно входа в сервис. Войдите и подтвердите доступ.

Как подключить biomcp1 к Cursor

Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Cursor:

https://biomcp1--gucci10248.run.tools

Быстрый способ: нажмите кнопку Открыть в Cursor ниже, Cursor сам предложит добавить сервер.

Вручную:

  1. В Cursor откройте Settings → Cursor Settings → MCP и нажмите Add new global MCP server.
  2. Вставьте JSON, скопированный ниже, в открывшийся файл ~/.cursor/mcp.json (для одного проекта: .cursor/mcp.json в корне проекта).
  3. Сохраните файл. Сервер появится в списке MCP; при необходимости пройдите авторизацию по кнопке рядом с ним.

Авторизация

Если сервис требует вход, рядом с сервером в списке MCP появится кнопка авторизации.

Список инструментов сервера (1)

Технические названия из tools/list. Нужны только разработчикам.

biomcpBioMCP is a read-only biomedical MCP tool for search, detail retrieval, discovery, enrichment, and study analytics across leading public biomedical data sources. # BioMCP Command Reference BioMCP connects to PubMed, ClinicalTrials.gov, ClinVar, gnomAD, OncoKB, Reactome, KEGG, UniProt, PharmGKB, CPIC, OpenFDA, Monarch Initiative, GWAS Catalog, and more. One command grammar covers all entities. ## Quickstart New to BioMCP? Try: - `suggest "What drugs treat melanoma?"` - choose the worked-example playbook for a question - `get gene BRAF` - look up a gene - `get gene BRCA1 diagnostics` - inspect GTR diagnostic tests for a known gene - `get disease tuberculosis diagnostics` - inspect up to 10 local diagnostic tests for a condition - `search diagnostic --gene BRCA1 --limit 5` - find genetic tests for a known gene - `search diagnostic --disease HIV --source who-ivd --limit 5` - find WHO infectious-disease diagnostics - `get variant "BRAF V600E"` - annotate a variant - `discover "chest pain"` - resolve a single-entity free-text phrase before choosing a typed command - `search trial -c melanoma` - find clinical trials - `search all --gene BRAF --disease melanoma` - cross-entity summary card ## When to Use What | You want to know... | Start with | |---|---| | I have a biomedical question and need the right playbook | `suggest "<question>"` | | How much NIH funded a disease or gene | `get disease <name_or_id> funding` or `get gene <symbol> funding` | | What drugs treat a disease | `search drug --indication "<disease>" --limit 5` | | What diagnostic test exists for a gene or disease | `get gene <symbol> diagnostics`, `get disease <name_or_id> diagnostics`, or `search diagnostic --gene <symbol> --limit 5` | | What the 5-year survival outlook is for a cancer | `get disease <name_or_id> survival` | | Symptoms or phenotypes of a disease | `get disease <name_or_id> phenotypes` | | MedlinePlus clinical-summary rows for a configured disease | `get disease <name_or_id> clinical_