BioCosm

Biotech intelligence for AI agents: drugs, targets, diagnostics, PoS estimates, and writeups.

От сообществаРаботаетБез входаГлобальныйБесплатноМожет изменять данные

Что умеет

    Какие данные видит

    Нужен ли аккаунт

    Не нужен: сервер работает без входа

    Biotech intelligence for AI agents: drugs, targets, diagnostics, PoS estimates, and writeups.

    Как подключить

    Как подключить BioCosm к Claude

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Claude:

    https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

    1. Откройте Claude (сайт claude.ai или приложение для компьютера).
    2. Перейдите в Настройки → Коннекторы (в английском интерфейсе: Settings → Connectors).
    3. Нажмите Добавить пользовательский коннектор (Add custom connector).
    4. Вставьте адрес сервера, скопированный ниже, в поле URL удалённого MCP-сервера и нажмите Добавить.
    5. В чате нажмите + → Коннекторы и включите новый коннектор.

    Пользовательские коннекторы доступны на тарифах Free, Pro, Max, Team и Enterprise. На Free можно добавить только один. В Team и Enterprise коннектор сначала добавляет владелец организации в Настройки организации → Коннекторы.

    Авторизация

    После нажатия Добавить откроется окно входа в сервис. Войдите под своим аккаунтом и подтвердите доступ. Пароль Claude не видит.

    Как подключить BioCosm к ChatGPT

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках ChatGPT:

    https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

    1. Откройте ChatGPT в браузере (chatgpt.com). Нужен тариф Plus, Pro, Business, Enterprise или Edu.
    2. Один раз включите режим разработчика: Настройки → Приложения → Дополнительные настройки → Режим разработчика (Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode).
    3. Откройте Настройки → Коннекторы и нажмите Создать (Create).
    4. Заполните форму: Название (любое), Описание (одна фраза, что делает сервис), URL MCP-сервера (скопируйте ниже).
    5. В поле Аутентификация выберите OAuth, если сервис требует вход, иначе Нет. Нажмите Создать.
    6. В новом чате откройте + → Приложения/Коннекторы и включите коннектор.

    Название раздела у OpenAI менялось (Connectors → Apps/Plugins). Если пункт называется иначе, ищите «режим разработчика» в настройках. В рабочих пространствах Business/Enterprise администратор должен разрешить пользовательские коннекторы.

    Авторизация

    При первом использовании ChatGPT откроет окно входа в сервис. Войдите и подтвердите доступ.

    Как подключить BioCosm к Cursor

    Адрес сервера, который нужно вставить в настройках Cursor:

    https://biocosm-mcp.fly.dev/mcp

    Быстрый способ: нажмите кнопку Открыть в Cursor ниже, Cursor сам предложит добавить сервер.

    Вручную:

    1. В Cursor откройте Settings → Cursor Settings → MCP и нажмите Add new global MCP server.
    2. Вставьте JSON, скопированный ниже, в открывшийся файл ~/.cursor/mcp.json (для одного проекта: .cursor/mcp.json в корне проекта).
    3. Сохраните файл. Сервер появится в списке MCP; при необходимости пройдите авторизацию по кнопке рядом с ним.

    Авторизация

    Если сервис требует вход, рядом с сервером в списке MCP появится кнопка авторизации.

    Список инструментов сервера (13)

    Технические названия из tools/list. Нужны только разработчикам.

    search_nodesSearch BioCosm nodes by name, gene symbol, target, therapeutic area, or company. Results are ranked: exact name/brand matches first, then partial name matches, with a node-type prior (canonical drug/diagnostic nodes rank above gene-target nodes, which rank above ChEMBL salt-form duplicates). Nodes matched only via description/company/area rank last. Each result includes a `name` field for disambiguation.
    get_nodeGet full details for a single BioCosm node: identity and all name aliases, classification, gene targets and mechanism, therapeutic areas, companies, revenue history where available (sparse: ~100 drugs, mostly blockbusters, as annualized quarterly estimates; source links when present), probability-of- success predictions for pipeline drugs (with confidence intervals and contributing factors), structured clinical trial outcomes, external cross-references, and writeup availability. Empty fields mean "not in BioCosm's coverage," NOT zero or absent in reality.
    get_writeupGet the full writeup for a BioCosm node, including all sections, citations, structured data, and validation score.
    list_by_therapeutic_areaList all nodes in a given therapeutic area.
    get_company_portfolioGet a company's full drug/diagnostic portfolio from BioCosm.
    get_statsGet a high-level overview of the BioCosm database: total nodes, writeups, companies, breakdowns by type/status/domain, validation scores, and recent pipeline runs.
    get_staleness_reportGet writeup staleness report: overall stats, top stale nodes, data source freshness.
    get_node_freshnessGet freshness details for a single node: writeup age, enrichment hash match, staleness score, validation score.
    find_by_targetFind all drugs that target a specific gene/protein.
    find_by_phaseList drugs/diagnostics at a specific clinical phase.
    find_relatedFind nodes connected to a given node. Three relationship types are derived on-the-fly: - "drug_target": for a drug, the targets it hits (and vice versa for a target node, the drugs that hit it) - "same_company": drugs sharing a company with this node - "same_target_class": drugs with the same mechanism_class
    get_pos_scoreGet the Probability of Success estimate for a node, including the base rate, adjustment factors with reasoning, confidence interval, and model version. Returns None for nodes without a PoS score (typically only late-stage pipeline drugs are scored).
    get_coverageReport BioCosm's actual data coverage so you never mistake missing data for a real-world zero. An empty or absent field on a node means "not in BioCosm's data," never a true zero. BioCosm is AI-generated and may contain errors.