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Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP.

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What it can do

    What data it sees

    Do you need an account

    No: the server works without sign-in

    Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

    How to connect

    How to connect raras to Claude

    The server address to paste into Claude settings:

    https://raras.org/api/mcp

    1. Open Claude (claude.ai or the desktop app).
    2. Go to Settings → Connectors.
    3. Click Add custom connector.
    4. Paste the server address copied below into Remote MCP server URL and click Add.
    5. In a chat, click + → Connectors and switch the new connector on.

    Custom connectors are available on Free, Pro, Max, Team and Enterprise plans (Free is limited to one). On Team and Enterprise an organization Owner adds the connector first under Organization settings → Connectors.

    Authorization

    After you click Add, a sign-in window for the service opens. Sign in with your own account and approve access. Claude never sees your password.

    How to connect raras to ChatGPT

    The server address to paste into ChatGPT settings:

    https://raras.org/api/mcp

    1. Open ChatGPT in a browser (chatgpt.com). A Plus, Pro, Business, Enterprise or Edu plan is required.
    2. Turn on developer mode once: Settings → Apps → Advanced settings → Developer mode.
    3. Open Settings → Connectors and click Create.
    4. Fill in the form: Name (anything), Description (one line about what the service does), MCP server URL (copy it below).
    5. Under Authentication choose OAuth if the service requires sign-in, otherwise None. Click Create.
    6. In a new chat open + → Apps/Connectors and enable the connector.

    OpenAI has renamed this section before (Connectors → Apps/Plugins). If the label differs, search settings for "developer mode". On Business/Enterprise workspaces an admin must allow custom connectors first.

    Authorization

    On first use ChatGPT opens the service's sign-in window. Sign in and approve access.

    How to connect raras to Cursor

    The server address to paste into Cursor settings:

    https://raras.org/api/mcp

    Fastest: click Open in Cursor below and confirm the prompt.

    Manually:

    1. In Cursor open Settings → Cursor Settings → MCP and click Add new global MCP server.
    2. Paste the JSON copied below into ~/.cursor/mcp.json (per project: .cursor/mcp.json in the repo root).
    3. Save the file. The server appears in the MCP list; authorize it there if asked.

    Authorization

    If the service needs sign-in, an authorize button appears next to the server in the MCP list.

    Server tool list (20)

    Raw names from tools/list. Only developers need these.

    search_diseasesFull-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.
    get_disease_detailFenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.
    find_diseases_by_phenotypesMatch por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.
    search_phenotypesLookup HPO em PT ou EN. Retorna IDs HP:.
    get_sus_coverageCEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.
    find_reference_centersCentros por doença e/ou UF, com CNES.
    find_active_trialsTrials ativos com filtro Brazil.
    find_similar_diseasesVector similarity via embeddings SOTA.
    find_phenotypically_similarDoenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).
    get_graph_statsContagens e métricas do dataset.
    search_papers_semanticBusca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.
    find_papers_for_diseaseLiteratura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).
    analyze_clinical_caseCaso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.
    get_schemaNode labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.
    explain_relationRaciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.
    get_literature_relationsRelações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.
    get_hypothesesCandidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).
    get_research_logRegistro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.
    get_recent_updatesDoenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).
    get_evidenceCross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".